BioQで検索できるすべてのデータ

未レビューのUniProtエントリをアクセッション番号で取得できます（初回の検索は1分ほどかかることがあります）。生物種ごとのタンパク質数も数えられます。

タンパク質配列を貼り付けると、レビュー済みの類似タンパク質をE-valueと配列同一性（%）付きで検索できます。

任意のMGnifyタンパク質（MGYP ID）とその配列を取得できます。クラスター代表配列に含まれないものも対象です。

メタゲノムの代表タンパク質をIDで検索できます。見つからない場合は「該当なし」とせず、MGnify全体を検索します。

土壌やヒト腸内など、任意のバイオームで見つかったタンパク質クラスターの数を、下位バイオームも含めて調べられます。

注目するクラスターと同じメタゲノムアセンブリに出現するタンパク質クラスターを、その生息環境とともに検索できます。

メタゲノムタンパク質のコンティグ上で隣接する遺伝子を、座標・鎖・ギャップ長とともに確認できます。

メタゲノムタンパク質のPfamドメインや、PF00078など特定のドメインを持つすべてのタンパク質を一覧できます。

既知ドメインを持たない大規模タンパク質ファミリーを検索し、バイオームやサイズで絞り込み、共出現するアノテーション済みファミリーを確認できます。

4文字のコードで、任意のPDBエントリの実験手法・分解能・タイトル・配列を取得できます。

Swiss-Protタンパク質にAlphaFoldモデルがあるか、予測の信頼度がどの程度かを確認できます。

標的遺伝子または薬剤について、IC50・Ki・Kd・EC50の測定値を一覧できます。単位の種類は混ぜずに区別し、全行にアッセイ種別を示します。

承認薬の標的に対する活性値を、ChEMBLやGtoPdbと並べて確認できます。

受容体・イオンチャネル・酵素について、専門家がキュレーションした親和性を遺伝子やリガンドから確認できます。

遺伝子またはゲノム領域内のバリアントを一覧し、病原性のものに絞り込み、レビューステータスを確認できます。意義不明のバリアントを格上げすることはありません。

タンパク質名（ヒトはUniProtアクセッション番号も可）から、既知および予測された相互作用パートナーをSTRINGの統合スコア付きで一覧できます。

遺伝子について実験で報告された物理的・遺伝的相互作用を、実験系とPubMed ID付きで検索できます。

ある遺伝子に依存するがん系統や、ある系統が依存する遺伝子を、変異情報とあわせて調べられます。

遺伝子の発現量やコピー数を、がん細胞株・系統間で比較できます。

ヒトの任意の領域の正確なDNA配列を読み出せます（例：chr11:1000000-1000100）。

古細菌・真菌・原生生物・ミトコンドリア・ウイルスのRefSeq配列の任意の領域を、アクセッション番号と座標で読み出せます。

マウスゲノムの任意の領域のDNA配列を読み出せます。

がん細胞株の薬剤感受性（uM単位のln IC50、AUC）を、GDSCデータセットごとに調べられます。

あるタンパク質配列と完全に一致する配列が、MGnifyの代表配列にすでに含まれているかを確認できます。

Swiss-Protの範囲を超えて、細菌・古細菌・植物・真菌・動物にわたりタンパク質のホモログを検索できます。

UniProt全体（90%冗長性）に対してタンパク質配列を検索できます。

ug/mLで報告されたChEMBLの結合値（各化合物の分子量で換算）と、ChEMBLが非標準とフラグ付けした行を追加します。

ChEMBL分子が活性を示すすべての標的や、ある標的で試験されたすべての分子を一覧できます。

PfamドメインのヒットをInterProエントリとその説明に変換できます。

バイオームで見つかったクラスターIDを、一部ではなく全件のリストで返します。

アラインメント検索では見落とされる遠縁ホモログを、埋め込みの類似度で検索できます。

指定した細胞株と発現プロファイルが最も近いがん細胞株を検索できます。