El agente de investigación para los datos públicos de la biología

Los datos de la biología son públicos. Usarlos, no tanto.

Casi todo lo que necesitas ya se ha medido y publicado. Está repartido en portales distintos, cada uno con sus propios identificadores, formatos de archivo y tamaños de descarga. Responder una sola pregunta solía requerir días de descargas, mapeo de identificadores y cruces en hojas de cálculo, si es que tu equipo podía siquiera abrir los archivos.

Una pregunta, todas las bases de datos, con las pruebas adjuntas

1. Pregunta como piensas

   Escribe una pregunta, un símbolo de gen, un número de acceso de UniProt o MGnify, un dominio Pfam, un fármaco, una secuencia o una coordenada. BioQ reconoce lo que has escrito y muestra cómo lo ha interpretado.

2. El agente planifica y consulta

   Ante una pregunta, el agente decide a qué bases de datos preguntar, ejecuta las consultas en paralelo y muestra cada paso con sus parámetros y tiempos.

3. Cada afirmación cita un registro

   Las cifras de la respuesta enlazan con la consulta que las produjo. Abre cualquier paso para ver los datos sin procesar, copiar la llamada a la API o descargar la tabla.

Pensado para las preguntas que de verdad se hacen los investigadores

Respuestas que resisten una revisión

Un buscador científico solo es útil si puedes defender lo que te dice. BioQ es estricto en cuatro aspectos.

{
  "trembl": {
    "status": "miss",
    "means": "the TrEMBL index was searched and does
      not carry this accession"
  },
  "pfam_domains": {
    "status": "not_applicable",
    "means": "no lookup was possible, so this is
      neither a hit nor a miss"
  }
}

GET /api/v1/affinity?gene=EGFR&drug=gefitinib
{
  "measured_type": "IC50", "value": 0.1, "unit": "nM",
  "unit_class": "molar",
  "source_key": "chembl_37.db|activity_id=13297481",
  "sha256": "4be13df3b68e…c15142"
}